reseña
El club fue fundado en 2016 como Nativet Fútbol Club, y tras varios cambios de nombre, en 2022 pasó a llamarse San Carlos Fútbol Club. Ese mismo año inició su participación en LINAFA, logrando en 2023 el subcampeonato del Torneo Apertura tras perder la final ante C. D. Pavas.
En diciembre de 2023, adquirió la franquicia de los Marineros de Puntarenas, lo que le permitió ingresar a la Segunda División de Costa Rica. Debutó en enero de 2024 con una victoria 0-6 sobre A. D. COFUTPA.
Para la temporada 2024-2025, el club cambió su nombre a Inter San Carlos, junto con sus colores y escudo.
